Entre la forêt dense qui la revêt, et les eaux claires qui la bordent,
Nosy Komba abrite une multitude d'espèces tropicales et endémiques; Makis Macacos, Caméléons, lézards, serpents, araignées, mais aussi tortues marines, raies, dauphins, et bien d'autres vies, la peuplent.

On dénombre une vingtaine de Batraciens et de reptiles différents ainsi que 19 espèces d'oiseaux recensées.

Hormis, la flore tropicale, que l'on retrouve sur toute l'île (188 noms) on y trouve aussi de nombreuses plantes médicinales (environ 70) que les Habitants de l'île utilisent comme principal remède.

Les moines Capucins pendant l'époque coloniale avaient implanté un Arboretum, de nombreux arbres du monde entier avaient été importés. Les nombreux cyclones et tempêtes qui sont passés sur l'île depuis les ont partiellement décimés. Ceux qui restent appartiennent à une zone de reboisement de 60 ha, contrôlée par les "Eaux et Forêts" Malgaches.